こどもの国線は、当初より社会福祉法人（1981年までは特殊法人）こどもの国協会が施設を保有し、東急に運転管理を委託する形で営業されていたが、地方鉄道法に代わる鉄道事業法施行により1987年（昭和62年）4月1日、協会が第三種鉄道事業者、東急が第二種鉄道事業者となる。
その後沿線の宅地化が進み人口が増加すると列車の運行時間帯拡大の要望が上がり、通勤線への転用が図られることになった。この行為は社会福祉法人としての目的から逸脱するため、こどもの国協会は1997年（平成9年）8月1日付で第三種鉄道事業を横浜高速鉄道に譲渡した。

1966年（昭和41年）11月1日：特殊法人こどもの国協会が設立される。
1967年（昭和42年）4月28日：弾薬庫への引込線跡を利用し、来園客の輸送を目的として、長津田駅とこどもの国駅を結ぶこどもの国線が開業。